制备液相色谱中，有三个可以观察到的状态：柱压、检测器基线、谱图。通过观察和记录这三个状态可以监测仪器是否正常。若某个状态出现异常，故障排查和解决方案如下。
1、柱压波动
1）吸液管路进气泡
①溶剂不足，吸滤头吸入空气，添加溶剂并排气泡。
②吸滤头脏了或堵塞，用异丙醇（或5%稀硝酸）清洗。
③溶剂中有气泡（尤其两种以上溶剂混合），超声（或抽滤）脱气。
2）泵流量不稳
①单向阀堵塞，大流速purge，若不能解决，则需拆下单向阀（异丙醇）超声清洗清洗或更换单向阀。
②柱塞密封圈磨损，更换密封圈。
③泵头污染，柱塞杆往复活动受阻，清洗泵头。
3）柱床塌陷，维修或更换色谱柱。
4）流动相混合后吸放热导致温度变化，以致柱压波动，如乙腈和水混合吸热，甲醇和水混合放热。若影响实验结果，则增加柱温箱或流动相预混。
2、柱压升高或超压。
逐段排查堵塞的位置：
1）先拆下色谱柱，接上两通运行，若是色谱柱堵塞：
①进样后样品析出，用合适的溶剂反冲色谱柱。
②缓冲盐析出，用大比例水相的流动相冲洗色谱柱。
③机械杂质堵塞筛板，异丙醇小流速反冲色谱柱。
④色谱柱污染严重，需维修或充填。
2）混合器堵塞，维修或更换。
3）六通阀堵塞，将泵液管路接到连接色谱柱的阀口处，将阀扳至load状态，用易溶样品的溶剂小流速冲洗。
4）压力传感器故障，维修或更换。
3、检测器基线波动
1）基线有规律波动，且幅度较大，则可能有气泡持续进入流通池。排查气泡来源并用异丙醇冲洗检测器或色谱柱。
2）基线小幅度规律波动，可能是检测器灯能量不足（能量下降后，低波长下灵敏度先下降。
3）基线漂移。
①流动相在此检测波长下有吸收。更换流动相或改变波长。
②色谱柱或检测池污染。以异丙醇冲洗色谱柱或检测池，或将检测池中透镜玻片取出清洗。
4、谱图重现性差
1）检查方法设置，包括流速、梯度、波长。
2）检查流动相配置是否有误，A、B两相是否放反。
3）检查柱压与之前是否有差异，若有变化，则前面1和2进行排查。
4）进样前色谱柱是否完全平衡好。
5）样品溶解方法。
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